Печера знаходиться недалеко від річки Збруч. Єдина на Поділлі вертикальна печера. І утворилася вона шляхом вимивання вапнякових порід водою.
Унікальна ще й тим, що свого часу тут були знайдені перлини. У вузьких важкодоступних ходах були заховані ванночки з печерними перлинами. Це досить рідкісне явище у природі. Кольору слонової кістки, білі, або жовтуваті горошини від 5 до 18 мм в діаметрі утворились із кальциту. Одна перлина може утворюватися за сотні або й тисячі років — все залежить від внутрішніх природних умов.
А загалом Перлина є таким собі колодязем серед лісу, який має 27 метрів у глибину. Недавно до входу добудували арку і печера стала виглядати, ніби житло фантастичних істот із казки. Насправді ж тут живуть кажани, а люди спускаються рідко. Для цього потрібне спеціальне обладнання, та й дозвіл спеціальний – від керівництва заповідника «Медобори».